Fattore II Protrombina su DNA

Sono diverse le proteine che intervengono in questo processo detto a cascata, in quanto esiste una sequenza ben definita. Le reazioni che intervengono sono tutte di tipo proteolitico (rottura del legame tra un amminoacido e l'altro) in cui in ogni tappa, un fattore della coagulazione, va incontro a proteolisi e si attiva. Il fattore attivato funge da attivatore per quello successivo fino alla formazione di un coagulo solido di fibrina. Il fibrinogeno (fattore I), precursore solubile della fibrina, è il substrato dell'enzima trombina (fattore IIa) (la trombina si forma per attivativazione della protrombina che rappresenta il fattore II). La protrombina è trasformata in trombina da un altri fattori l'X (attivato Xa) e Va. I dettagli della coagulazione sono ben più complicati e a seconda del tipo di ferita o danno possiamo avere due vie, una estrinseca e una intriseca. La differenza di queste due vie sta nella velocità di risposta al danno, infatti la via estrinseca è più veloce ma non porta a un coagulo stabile, e i fattori plasmatici  che intervengono sono VII, X e V (pur non portando a un coagulo stabile questa via se non funzionante è responsabile di malattie come le emofilie), la via intrinseca è più lenta ed viene innescata dall'attivazione del fattore XI o fattore di Hageman e insieme agli altri fattori della via estrinseca vengono attivati anche i fattori  XII, XI, IX e VIII, tutti fattori plasmatici. Eseguire l'analisi dei fattori della coagulazione, tutti quelli necessari alla cascata, significa misurare la funzionalità, e talvolta la quantità, alla ricerca di alterazioni sia quantitative che qualitative. Questi fattori sono soggetti a mutuzioni e tra queste le mutazioni più importanti sono quella a carico del fattore V di Leiden e della protrombina 20210 ambedue formano dei fattori non corretti che aumentano il rischio di trombosi. Gli esami per la ricerca di queste mutazioni sono simili ma diversi e solitamente vengono fatti tutti e due per capire se c'è rischio di disordini della coalgulazione.